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AI預(yù)測超過2億個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

2022年08月01日08:33 來源:科技日報

科技日報北京7月31日電 (記者劉霞)據(jù)英國《新科學家》雜志網(wǎng)站近日報道,總部位于英國的人工智能公司“深度思維”宣布,將公布超2億個蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。該公司在短短18個月內(nèi),憑借“阿爾法折疊”算法,預(yù)測了迄今被編目的幾乎所有蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),破解了生物學領(lǐng)域最重大的挑戰(zhàn)之一,將助力應(yīng)對抗生素耐藥性、加速藥物開發(fā)并徹底改變基礎(chǔ)科學。

幾十年來,根據(jù)氨基酸序列確定蛋白質(zhì)形狀一直是生物學領(lǐng)域的一大難題。2020年底,“深度思維”宣布,該公司的“阿爾法折疊”算法能準確預(yù)測折疊蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu);2021年中,該人工智能已經(jīng)能繪制人體內(nèi)98.5%的蛋白質(zhì)。近日,該公司宣布將公布超2億個蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),幾乎所有這些蛋白質(zhì)都被編入全球公認的蛋白質(zhì)研究庫UniProt。

“深度思維”也在與歐洲分子生物學實驗室下屬歐洲生物信息學研究所合作,創(chuàng)建一個可搜索數(shù)據(jù)庫“阿爾法折疊蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫”,研究人員可輕松、自由地訪問相關(guān)信息,使搜尋蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變得幾乎和網(wǎng)絡(luò)搜索工具一樣簡單。

很多科學家正在利用“阿爾法折疊”推進多個領(lǐng)域的研究,如牛津大學的馬特·希金斯等人正在研究一種他們認為是中斷瘧疾寄生蟲生命周期的關(guān)鍵蛋白質(zhì),希望研制出有效的瘧疾疫苗;也有科學家用其設(shè)計新酶來分解塑料垃圾,并進一步了解使細菌對抗生素產(chǎn)生耐藥性的蛋白質(zhì)。

倫敦帝國理工學院的基思·威廉姆森表示,“阿爾法折疊”改變了生物學研究,但仍存在一些問題,如它無法提取任意氨基酸序列,并精確模擬它們的折疊方式,也無法揭示蛋白質(zhì)之間復(fù)雜的相互作用,另外,其在準確性方面還有待改進。

“深度思維”公司表示,目前正致力于提高該工具的準確性,以進一步了解蛋白質(zhì)如何生成以及細胞如何工作。

(責編:喬業(yè)瓊、楊迪)




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