新型蛋白質(zhì)改造方法成功開發(fā)
科技日報訊 (記者陸成寬)記者8月11日從中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所獲悉,該所科研人員聯(lián)合其他單位的科研人員,成功開發(fā)了一種基于人工智能(AI)的新型蛋白質(zhì)改造方法。該方法巧妙地利用了現(xiàn)有通用蛋白質(zhì)逆折疊AI模型,無需訓練專屬AI模型,即可實現(xiàn)蛋白質(zhì)高效進化模擬和功能設計。相關(guān)研究成果日前在線發(fā)表于《細胞》。
蛋白質(zhì)改造就像給生物分子做“改裝”,通過調(diào)整氨基酸順序改變蛋白質(zhì)性能。相較于基因改造,蛋白質(zhì)改造更為直接高效,能夠快速獲得自然界歷經(jīng)百萬年進化才可能產(chǎn)生的特性。
然而,現(xiàn)有的蛋白質(zhì)改造技術(shù)存在明顯短板:傳統(tǒng)方法高度依賴專家經(jīng)驗,耗時長、成本高;而新興的AI預測技術(shù)需要為每種蛋白質(zhì)單獨訓練專用模型,不僅通用性差,還特別消耗計算資源?!懊鎸@些挑戰(zhàn),我們急需找到一種更‘聰明’的辦法,開發(fā)出通用性強、效率高且不依賴昂貴算力的新型AI解決方案?!闭撐耐ㄓ嵶髡?、中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所研究員高彩霞說。
現(xiàn)有通用蛋白質(zhì)逆折疊AI模型,可根據(jù)給定的三維結(jié)構(gòu),預測蛋白質(zhì)可能的氨基酸排列?;诂F(xiàn)有通用蛋白質(zhì)逆折疊模型,科研人員開發(fā)了AiCEsingle模塊,推出了一種新型蛋白質(zhì)改造方法。
測試結(jié)果發(fā)現(xiàn),新方法的預測準確率達16%,性能比其他常見AI模型提升36%—90%。同時,在實驗驗證環(huán)節(jié),科研人員用新方法成功改造了8種功能各異的蛋白質(zhì),包括基因編輯關(guān)鍵工具脫氨酶等。
高彩霞表示,這個智能蛋白質(zhì)改造新方法,相比傳統(tǒng)手段效率更高、適用性更廣、擴展性更強。它代表著生命科學領(lǐng)域的重要趨勢,即用計算模擬部分替代實驗室操作。特別值得一提的是,新方法大幅降低了AI技術(shù)的使用門檻,普通實驗室無需配備昂貴算力就能享受智能預測的便利,讓更多科學家受益。
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